Las competencias y funciones se gestionan a través de las siguientes unidades:

• Unidad Orgánica de Apoyo Económico-Financiero
• Unidad Orgánica de Transporte Guiado
• Unidad Orgánica de Apoyo Administrativo
• Unidad Orgánica de Inspección de Transportes
  • Unidad Funcional de Incoación y Calificación de Expedientes Sancionadores
  • Unidad Funcional de Inspección
  • Unidad Funcional de Recursos de Expedientes Sancionadores
  • Unidad Funcional de Instrucción de Expedientes Sancionadores
  • Unidad Funcional de Recaudación-Apoyo Administrativo
  • Unidad Funcional de Contrato-Programa Inspección Concesiones
• Unidad Orgánica de Gestión de Autorizaciones
  • Unidad Funcional de Servicio Público de Mercancías
  • Unidad Funcional de Servicio Privado de Mercancías
  • Unidad Funcional de Servicio Público de Viajero: Taxis
  • Unidad Funcional de Actividades Auxiliares: Alquiler sin Conductor
  • Unidad Funcional de Servicio Público de Viajeros Discrecionales, Regulares, Sanitarios y Funerarios